Нет.
Очистка кэша приложения никак не влияет на пользовательские данные. Данные карт не удаляются ни при каких обстоятельствах. При переустановке приложения или повторном входе в систему удаляются только активные платёжные токены. После входа или переустановки вам потребуется повторно активировать карты.